# 生物医学NLP

BioClinical ModernBERTは、ModernBERTをベースに構築された生物医学および臨床自然言語処理モデルで、長文脈処理能力を備え、生物医学および臨床NLPタスクで優れた性能を発揮します。

Pythia-410mアーキテクチャに基づく細胞タイプ予測モデルで、Cell2SentenceメソッドによりscRNA-seqデータを'細胞文'に変換して微調整を行い、単細胞RNAシーケンスデータの細胞タイプ予測に特化しています。

BioMistral - MedMNXは、複数の事前学習モデルを融合することで作成された生物医学分野専用の言語モデルで、DAREとTIESの融合方法を用いて性能を最適化しています。

sentence - transformersに基づく多言語医学テキストの文埋め込みモデルで、8つの言語をサポートします。

MPNetアーキテクチャに基づく汎用文埋め込みモデルで、文類似度タスクに最適化されており、特に臨床試験結果の類似性分析に適しています。

Bio_ClinicalBERTはBERTアーキテクチャに基づく臨床テキスト処理モデルで、生物医学および臨床分野のテキストに特化して最適化されています。

SciFive-base-Pubmed_PMCをファインチューニングしたT5モデルで、放射線レポート要約生成タスク向けに設計されており、MIMIC-IIIデータセットで訓練

DrugGPTはGPT2アーキテクチャに基づく生成型医薬品設計モデルで、自然言語処理技術を用いて創薬に革新をもたらします。

PMC_LLaMA_7BはLLaMA-7bをS2ORCデータセットのPMC論文で微調整したバージョンで、医療分野のテキスト生成タスクに特化しています。

DeBERTa v2アーキテクチャに基づく学術論文専用言語モデルで、科学文献処理タスクで優れた性能を発揮

PubMedBERTベースの文変換モデルで、文や段落の768次元ベクトル表現を生成し、意味検索やクラスタリングタスクに適しています。

トランスフォーマーとルールベース手法を組み合わせた放射線レポート自動非識別化システム。PHIエンティティを検出し擬似値で置換

本モデルはタンパク質の遺伝子オントロジー定義をベクトル表現にエンコードし、遺伝子レベルの類似性や機能用語間の比較を探求することを目的としています。

164,179件のCOVID-19要約で事前学習された生物医学言語モデルで、COVID-19主題分類タスクで優れた性能を発揮

BioLinkBERTはPubMedの抄録と文献引用リンク情報に基づいて事前学習された改良版BERTモデルで、生物医学NLPタスクに優れています

科学テキストで訓練されたBERTモデルSciBERTの小型言語モデリング拡張版で、特にCOVID-19関連研究向けに最適化されています

SciBERTに基づく科学テキストの文エンコーダーで、自己教師付き学習により200万本の科学論文で学習されました。

PubMed文献要約を用いて事前学習された生物医学ドメイン固有のBERTモデルで、複数の生物医学NLPタスクで最先端の性能を実現します。

BiomedBERTはPubMedの抄録とPubMedCentralの全文を用いて事前学習された生物医学分野特化の言語モデルで、多くの生物医学NLPタスクで最先端の性能を達成しています。

Bio+Clinical BERTはBioBERTから初期化された臨床BERTモデルで、MIMIC IIIのすべてのノートで訓練されており、生物医学および臨床テキスト処理に適しています。

BERT、ALBERT、ELECTRAをベースに構築された大型の生物医学言語モデルで、生物医学分野のタスクに特化しています。

BioBERTを初期化し、健康関連のReddit投稿でさらに事前学習を行ったBERTモデルで、ソーシャルメディアの医療テキスト処理に特化

VetBERTは、獣医臨床ノートの処理に特化した事前学習言語モデルで、Bio_ClinicalBERTをベースに獣医医学分野のデータでさらに学習されています。

BART-large-cnnを医学文献要約データセットで微調整したテキスト生成モデルで、医学文献要約生成タスクに特化しています。

RoBERTaの基礎事前学習モデルに基づき、生命科学分野の英語科学テキストでさらに学習した言語モデル