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Segment Nt Multi Species

InstaDeepAIによって開発
SegmentNT-multi-speciesは、Nucleotide Transformerに基づくセグメンテーションモデルで、単一ヌクレオチド解像度で複数のゲノム要素の位置を予測します。
ダウンロード数 102
リリース時間 : 3/5/2024

モデル概要

このモデルはSegmentNTモデルを基に、ヒトおよび5つの選ばれた種(マウス、ニワトリ、ショウジョウバエ、ゼブラフィッシュ、線虫)のゲノムデータセットで微調整され、7つの主要な遺伝子要素の位置を予測できます。

モデル特徴

多種対応
ヒトおよび他の5種(マウス、ニワトリ、ショウジョウバエ、ゼブラフィッシュ、線虫)のゲノム解析をサポートします。
高解像度セグメンテーション
単一ヌクレオチド解像度でゲノム要素の位置を予測できます。
効率的なトレーニング
DGXH100ノードで8つのGPUを使用し、3日間の微調整を行い、合計80億トークンを処理しました。

モデル能力

ゲノム要素予測
DNA配列解析
多種ゲノムセグメンテーション

使用事例

ゲノム学研究
遺伝子要素位置特定
DNA配列中のエクソン、イントロンなどの遺伝子要素の位置を予測します。
7つの主要な遺伝子要素の位置を正確に識別できます。
種間比較
異なる種間のゲノム要素の類似性と差異を分析します。
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