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HIV V3 Bodysite

damlabによって開発
HIV-BERTを最適化したモデルで、HIV V3ループサンプルの採取部位を予測し、精度が元のモデルより大幅に向上
ダウンロード数 257
リリース時間 : 3/2/2022

モデル概要

HIVゲノム配列を通じてウイルスの由来組織部位を予測し、潜伏ウイルスリザーバの細胞起源研究に適用可能

モデル特徴

組織位置予測
HIVウイルス粒子の人体内における最終的な位置組織を推測可能
クロスサブタイプ適応性
主にBサブタイプ向けに最適化されているが、他のHIVサブタイプの予測もサポート(追加トレーニング必要)
マルチラベル出力
単一配列が複数の非排他的部位に対応する確率予測をサポート

モデル能力

HIV配列解析
組織部位確率予測
バイオマーカー分類

使用事例

医学研究
潜伏ウイルスリザーバの起源追跡
V3配列を通じてHIVウイルスの体内潜伏位置を追跡
治療計画の最適化
ウイルス分布特性に基づいて標的治療戦略を策定
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