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Marker Associations Binary Base

jamboによって開発
PubMedBERTを生物医学テキストでファインチューニングした二分類モデルで、マーカー関連分類タスクに使用
ダウンロード数 16
リリース時間 : 3/2/2022

モデル概要

このモデルはmicrosoft/BiomedNLP-PubMedBERT-base-uncased-abstract-fulltextをファインチューニングしたバージョンで、生物医学分野のマーカー関連二分類タスクを処理するために特別に設計されており、遺伝子と化学物質などのエンティティ間の関連関係を識別できます。

モデル特徴

生物医学分野最適化
PubMedBERT事前学習モデルに基づき、生物医学テキストに特化して最適化
高再現率
評価データセットで高い再現率を示し、特に化学物質カテゴリの再現率は100%を達成
バランス性能
精度と再現率の間で良好なバランスを達成し、F1値は約0.87

モデル能力

生物医学テキスト分類
遺伝子関連識別
化学物質関連識別
二分類タスク処理

使用事例

生物医学研究
遺伝子-疾患関連分析
文献中の遺伝子と疾患間の関連関係を識別
精度0.808、再現率0.940
薬物-ターゲット相互作用識別
文献から化学物質と生物学的ターゲット間の相互作用関係を抽出
精度0.774、再現率1.0
文献マイニング
生物医学エンティティ関係抽出
PubMedなどの生物医学文献からエンティティ間の関連関係を抽出
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