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Prot Bert Finetuned Smiles Bindingdb

由nepp1d0開發
基於Rostlab/prot_bert微調的蛋白質-SMILES相互作用預測模型
下載量 26
發布時間 : 5/1/2022

模型概述

該模型是基於prot_bert在蛋白質-SMILES相互作用數據集上微調的版本,主要用於預測蛋白質與小分子(SMILES)之間的結合特性。

模型特點

蛋白質序列理解
能夠有效理解蛋白質序列特徵和結構信息
SMILES編碼處理
可以處理化學小分子的SMILES表示形式
微調優化
在BindingDB相關數據集上進行了針對性微調

模型能力

蛋白質序列特徵提取
小分子-蛋白質相互作用預測
生物分子結合特性分析

使用案例

藥物發現
虛擬篩選
預測候選藥物分子與靶標蛋白的結合可能性
藥物重定位
發現已有藥物與新型靶標的潛在相互作用
生物化學研究
蛋白質-配體相互作用分析
研究蛋白質與各種小分子配體的結合特性
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