Prot Bert Finetuned Smiles Bindingdb
Rostlab/prot_bertをベースに微調整したタンパク質-SMILES相互作用予測モデル
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リリース時間 : 5/1/2022
モデル概要
このモデルはprot_bertをタンパク質-SMILES相互作用データセットで微調整したバージョンで、主にタンパク質と小分子(SMILES)間の結合特性を予測するために使用されます。
モデル特徴
タンパク質配列理解
タンパク質配列の特徴と構造情報を効果的に理解できる
SMILESエンコーディング処理
化学小分子のSMILES表現形式を処理できる
ファインチューニング最適化
BindingDB関連データセットで特定の微調整が行われた
モデル能力
タンパク質配列特徴抽出
小分子-タンパク質相互作用予測
生体分子結合特性分析
使用事例
創薬
仮想スクリーニング
候補薬物分子と標的タンパク質の結合可能性を予測
ドラッグリポジショニング
既存薬物と新規標的の潜在的な相互作用を発見
生化学研究
タンパク質-リガンド相互作用分析
タンパク質と様々な小分子リガンドの結合特性を研究
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