P

Prot Bert Finetuned Smiles Bindingdb

nepp1d0によって開発
Rostlab/prot_bertをベースに微調整したタンパク質-SMILES相互作用予測モデル
ダウンロード数 26
リリース時間 : 5/1/2022

モデル概要

このモデルはprot_bertをタンパク質-SMILES相互作用データセットで微調整したバージョンで、主にタンパク質と小分子(SMILES)間の結合特性を予測するために使用されます。

モデル特徴

タンパク質配列理解
タンパク質配列の特徴と構造情報を効果的に理解できる
SMILESエンコーディング処理
化学小分子のSMILES表現形式を処理できる
ファインチューニング最適化
BindingDB関連データセットで特定の微調整が行われた

モデル能力

タンパク質配列特徴抽出
小分子-タンパク質相互作用予測
生体分子結合特性分析

使用事例

創薬
仮想スクリーニング
候補薬物分子と標的タンパク質の結合可能性を予測
ドラッグリポジショニング
既存薬物と新規標的の潜在的な相互作用を発見
生化学研究
タンパク質-リガンド相互作用分析
タンパク質と様々な小分子リガンドの結合特性を研究
AIbase
未来を切り開く、あなたのAIソリューション知識ベース
© 2025AIbase