SPIDER Breast Model

🚀 SPIDER-Breast Model

SPIDER-breastモデルは、乳腺のパッチレベルの病理分類に特化した深層学習モデルです。SPIDERデータセットイニシアチブの一部で、専門家による注釈付きの高品質な多臓器病理データセットを提供します。

🚀 クイックスタート

モデルは1120×1120のパッチで動作します。以下のコードスニペットを使用して、モデルをロードして利用します。

from transformers import AutoModel, AutoProcessor
from PIL import Image

model = AutoModel.from_pretrained("histai/SPIDER-breast-model", trust_remote_code=True)
processor = AutoProcessor.from_pretrained("histai/SPIDER-breast-model", trust_remote_code=True)

image = Image.open("path_to_image.png")
inputs = processor(images=image, return_tensors="pt")
outputs = model(**inputs)
print(outputs.predicted_class_names)

✨ 主な機能

SPIDER-breastモデルは、乳腺のパッチレベルの病理分類に特化しており、SPIDERデータセットを用いて訓練された深層学習モデルです。

📦 インストール

このモデルはtransformersライブラリを使用しています。以下のコマンドでインストールできます。

pip install transformers

💻 使用例

基本的な使用法

from transformers import AutoModel, AutoProcessor
from PIL import Image

model = AutoModel.from_pretrained("histai/SPIDER-breast-model", trust_remote_code=True)
processor = AutoProcessor.from_pretrained("histai/SPIDER-breast-model", trust_remote_code=True)

image = Image.open("path_to_image.png")
inputs = processor(images=image, return_tensors="pt")
outputs = model(**inputs)
print(outputs.predicted_class_names)

📚 ドキュメント

モデルの説明

SPIDER-breastモデルは、乳腺のパッチレベルの病理分類に特化した深層学習モデルです。SPIDERデータセットイニシアチブの一部で、専門家による注釈付きの高品質な多臓器病理データセットを提供します。

もしSPIDERデータやモデルのサポート、スポンサーシップ、または商用ライセンスを取得したい場合は、models@hist.aiまでご連絡ください。

モデルのソース

• リポジトリ: https://github.com/HistAI/SPIDER
• 論文: SPIDER: A Comprehensive Multi-Organ Supervised Pathology Dataset and Baseline Models

訓練データ

このモデルはSPIDER-breastデータセットで訓練されています。これはSPIDERデータセットのサブセットで、以下のクラスを含んでいます。

総数:

• 92,892 中央パッチ
• 984,924 総パッチ数（コンテキストパッチを含む）
• 921 注釈付けに使用された総スライド数

結果

📄 ライセンス

このモデルはCC BY-NC 4.0ライセンスの下にあり、研究用途のみで使用可能です。

引用

このモデルを使用する場合は、以下を引用してください。

@misc{nechaev2025spidercomprehensivemultiorgansupervised,
      title={SPIDER: A Comprehensive Multi-Organ Supervised Pathology Dataset and Baseline Models}, 
      author={Dmitry Nechaev and Alexey Pchelnikov and Ekaterina Ivanova},
      year={2025},
      eprint={2503.02876},
      archivePrefix={arXiv},
      primaryClass={eess.IV},
      url={https://arxiv.org/abs/2503.02876}, 
}

詳細情報

他のモデルやSPIDERデータセットを探索するには、Hugging Face HistAIページまたはGitHubを訪問してください。

連絡先

• 著者: Dmitry Nechaev, Alexey Pchelnikov, Ekaterina Ivanova
• メール: dmitry@hist.ai, alex@hist.ai, kate@hist.ai