🚀 SPIDER-Skinモデル
SPIDER-skinモデルは、皮膚のパッチレベルの病理分類のために訓練された深層学習モデルです。SPIDERデータセットイニシアチブの一部で、専門家による注釈付きラベルを持つ大規模で高品質な多臓器病理データセットを提供します。
✨ 主な機能
SPIDER-skinモデルは、皮膚のパッチレベルの病理分類に特化した深層学習モデルです。SPIDERデータセットイニシアチブの一環として、専門家による注釈付きラベルを持つ大規模で高品質な多臓器病理データセットを利用して訓練されています。SPIDERデータやモデルに対するサポート、スポンサーシップ、または商用ライセンスを取得したい場合は、models@hist.aiまでご連絡ください。
📦 インストール
このモデルはtransformers
ライブラリを使用しています。以下のコードを使用してモデルをロードし、使用することができます。
from transformers import AutoModel, AutoProcessor
from PIL import Image
model = AutoModel.from_pretrained("histai/SPIDER-skin-model", trust_remote_code=True)
processor = AutoProcessor.from_pretrained("histai/SPIDER-skin-model", trust_remote_code=True)
image = Image.open("path_to_image.png")
inputs = processor(images=image, return_tensors="pt")
outputs = model(**inputs)
print(outputs.predicted_class_names)
📚 ドキュメント
モデルの説明
SPIDER-skinモデルは、皮膚のパッチレベルの病理分類のために訓練された深層学習モデルです。SPIDERデータセットイニシアチブの一部で、専門家による注釈付きラベルを持つ大規模で高品質な多臓器病理データセットを提供します。
モデルのソース
訓練データ
このモデルは、SPIDERデータセットのサブセットであるSPIDER-skinデータセットを使用して訓練されています。データセットには以下のクラスが含まれています。
クラス |
中央パッチ数 |
Actinic keratosis |
4936 |
Apocrine glands |
6739 |
Basal cell carcinoma |
6446 |
Carcinoma in situ |
5478 |
Collagen |
6262 |
Epidermis |
7449 |
Fat |
6525 |
Follicle |
8343 |
Inflammation |
5856 |
Invasive melanoma |
9101 |
Kaposi’s sarcoma |
4778 |
Keratin |
6418 |
Melanoma in situ |
4545 |
Mercel cell carcinoma |
5968 |
Muscle |
6051 |
Necrosis |
6842 |
Nerves |
4735 |
Nevus |
8937 |
Sebaceous gland |
6639 |
Seborrheic keratosis |
10311 |
Solar elastosis |
7613 |
Squamous cell carcinoma |
6051 |
Vessels |
7673 |
Wart |
6158 |
合計数:
- 159,854 中央パッチ
- 2,696,987 総パッチ数(コンテキストパッチを含む)
- 3,784 注釈付けに使用された総スライド数
結果
臓器 |
正解率 |
適合率 |
F1スコア |
皮膚 |
0.940 |
0.936 |
0.938 |
📄 ライセンス
このモデルはCC BY-NC 4.0ライセンスの下で提供されており、研究用途のみで使用することができます。
引用
このモデルを使用する場合は、以下を引用してください。
@misc{nechaev2025spidercomprehensivemultiorgansupervised,
title={SPIDER: A Comprehensive Multi-Organ Supervised Pathology Dataset and Baseline Models},
author={Dmitry Nechaev and Alexey Pchelnikov and Ekaterina Ivanova},
year={2025},
eprint={2503.02876},
archivePrefix={arXiv},
primaryClass={eess.IV},
url={https://arxiv.org/abs/2503.02876},
}
詳細情報
他のモデルやSPIDERデータセットを探索するには、Hugging Face HistAIページまたはGitHubを訪問してください。
連絡先
- 著者: Dmitry Nechaev, Alexey Pchelnikov, Ekaterina Ivanova
- メール: dmitry@hist.ai, alex@hist.ai, kate@hist.ai