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Singlebertmodel ProtBertfinetuned Smilesbindingdb
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Singlebertmodel ProtBertfinetuned Smilesbindingdb

nepp1d0によって開発
このモデルはRostlab/prot_bertをファインチューニングしたバージョンで、タンパク質配列とSMILES分子表現間の関連タスクを処理するために使用されます。
大規模言語モデル
Transformers
#タンパク質配列解析#分子結合予測#バイオメディカル研究
ダウンロード数 38
リリース時間 : 4/13/2022

モデル概要

ProtBERTアーキテクチャに基づくファインチューニングモデルで、タンパク質配列と化学分子(SMILES)の結合予測タスクに特化しています。

モデル特徴

タンパク質配列理解
ProtBERT事前学習モデルに基づき、強力なタンパク質配列特徴抽出能力を有する
SMILES分子処理
化学分子のSMILES表現形式を処理可能
結合予測
タンパク質と化学分子間の結合特性を予測

モデル能力

タンパク質配列特徴抽出
化学分子表現処理
タンパク質-分子結合予測

使用事例

創薬
薬物ターゲット予測
低分子医薬品と標的タンパク質の結合可能性を予測
生化学研究
タンパク質-リガンド相互作用分析
タンパク質と各種化学リガンドの相互作用特性を研究
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