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Saprot 650M AF2

由 westlake-repl 开发
SaProt是一个基于蛋白质序列和结构信息的预训练模型,特别针对低pLDDT区域进行了优化。
下载量 5,630
发布时间 : 10/2/2023

模型简介

SaProt是一个结合蛋白质序列和结构信息的预训练模型,能够处理包含低置信度结构区域的蛋白质序列,支持突变效应预测和蛋白质嵌入生成。

模型特点

低pLDDT区域处理
能够有效处理蛋白质序列中的低置信度结构区域(pLDDT < 70)。
突变效应预测
支持预测蛋白质序列中特定位置的突变效应,包括单点突变和组合突变。
蛋白质嵌入生成
可以生成蛋白质序列的嵌入表示,用于下游任务分析。
两种使用方式
提供通过Huggingface接口和原始ESM方式两种使用途径。

模型能力

蛋白质序列分析
突变效应预测
蛋白质嵌入生成
低置信度区域处理

使用案例

蛋白质工程
突变效应预测
预测蛋白质特定位置突变对结构和功能的影响
可获得突变后的效应值和概率分布
蛋白质研究
蛋白质表征学习
生成蛋白质序列的嵌入表示
可用于下游任务如蛋白质分类或功能预测
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