R

Rnabert

由multimolecule開發
RNABERT是基於非編碼RNA(ncRNA)的預訓練模型,採用掩碼語言建模(MLM)和結構對齊學習(SAL)目標。
下載量 8,166
發布時間 : 9/10/2024

模型概述

RNABERT是一個bert風格的模型,通過自監督方式在大量非編碼RNA序列上進行預訓練,主要用於RNA序列的特徵提取和結構對齊。

模型特點

雙目標預訓練
同時採用掩碼語言建模(MLM)和結構對齊學習(SAL)兩種預訓練目標
RNA專用模型
專門針對非編碼RNA序列設計和訓練
輕量級架構
僅0.48M參數,適合RNA序列處理任務

模型能力

RNA序列特徵提取
RNA結構對齊預測
RNA序列掩碼預測

使用案例

生物信息學
RNA功能聚類
利用模型提取的RNA序列特徵進行功能聚類分析
RNA結構對齊
預測兩個RNA序列之間的結構對齊關係
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