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Segment Nt

InstaDeepAIによって開発
SegmentNTはNucleotide TransformerベースのDNAセグメンテーションモデルで、単一塩基解像度で配列中の多様なゲノム要素の位置を予測できます。
ダウンロード数 546
リリース時間 : 3/4/2024

モデル概要

SegmentNTはDNA基礎モデルのセグメンテーションモデルで、最大30kbのヒトゲノム入力配列において、遺伝子や制御要素を含む14種類の異なるゲノム要素の位置を予測できます。

モデル特徴

高解像度セグメンテーション
単一塩基解像度でゲノム要素の位置を予測可能
長鎖処理
最大30kbのDNA配列を処理可能(50kbまで拡張可)
多要素予測
遺伝子や制御要素を含む14種類の異なるゲノム要素を予測可能

モデル能力

DNA配列セグメンテーション
ゲノム要素予測
長鎖処理

使用事例

ゲノム学研究
遺伝子構造予測
タンパク質コード遺伝子、非コードRNAなどの遺伝子構造要素を予測
高精度な単一塩基解像度予測
制御要素識別
プロモーター、エンハンサーなどの制御要素を識別
組織特異的および組織不変の制御要素を区別可能
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