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Plantcaduceus L20

kuleshov-groupによって開発
PlantCaduceusは16種の被子植物ゲノムで事前学習されたDNA言語モデルで、CaduceusとMambaアーキテクチャを採用し、マスク言語モデリング目標を通じて進化的保存性とDNA配列文法を学習します。
ダウンロード数 8,967
リリース時間 : 5/19/2024

モデル概要

PlantCaduceusは植物ゲノム配列の処理と分析に特化したDNA言語モデルで、進化的保存性とDNA配列文法を学習できます。

モデル特徴

多種ゲノム事前学習
16種の被子植物ゲノムで事前学習され、1.6億年の進化史をカバーします。
多様なパラメータ規模
2000万から2.25億パラメータまでの様々な規模のモデルを提供し、異なる計算ニーズに対応します。
進化的保存性学習
DNA配列中の進化的保存性と文法規則を学習できます。

モデル能力

DNA配列解析
ゲノムマスク言語モデリング
進化的保存性予測

使用事例

ゲノム研究
DNA配列スコアリング
モデルを使用してDNA配列のゼロショットスコア推定を行います。
進化的保存性解析
異なる種のDNA配列中の保存領域を分析します。
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